연구 과제
발굴·데이터
계산 발굴과 데이터 기반 연구입니다. 구조기반 저분자 설계, 프라이버시 보존 다중오믹스 합성데이터, 변이·표현형 기반 희귀질환 진단을 다룹니다.
과제
목표, 근거, 다음 검증 — 따로 적습니다
목표는 과제가 닿으려는 값입니다. 근거는 어떤 범위에서 무엇을 쟀는지입니다. 다음 검증은 판단을 바꿀 일입니다.
| 과제 | 내부 목표 | 지금까지의 근거 | 다음 검증 |
|---|---|---|---|
| 5-1 · AI 신약발굴 | 결합 자유에너지 오차 1 kcal/mol 이하 | 공통 가상 시험 | 실측 결합값이 있는 기록과 평가 조건을 고르고 골격·표적군·시점별 분할을 동결합니다. |
| 8-1 · 합성데이터 | 원본 대비 하류 예측 성능 보존율 95% 이상 | 가상 하네스 (synth8) · 공통 가상 시험 | 고정된 TCGA-BRCA 기관 분할에서 같은 하네스로 기준 생성기를 먼저 측정하고, 주 생성기를 학습해 같은 프라이버시 예산에서 모든 종점이 기준 생성기를 넘는지 확인합니다. |
| 19-1 · 희귀질환 판독 | 원인 유전자 상위 5순위 검출률 90% 이상 | 공개 문헌 사례 평가 · 실자료 감사 (acmg19) · 가상 시험 (rare19) · 공통 가상 시험 | 표본이 아니라 전문가 병원성 미스센스 전체의 문헌을 읽어 기능 실험·가계 분리·환자 관찰 소견을 장부에 넣습니다. 그 뒤 지금의 40개 밖 유전자에서 민감도를 다시 재고, 특이도가 떨어지지 않는 것을 조건으로 둡니다. |
평가 자료
5-1 · 2018 GC4 · 제공기관 저장소 a7df7f521c234a03c97c26fe3755784381156197
D3R Grand Challenge 4 공식 Free Energy Set
5-1 · 해당 종점 적격 세트 미확정
자유에너지 열역학 실측 및 독립 골격 검증 자료
8-1 · PanCancer Atlas 2018 · cBioPortal dda832891555904730395d476c5c888b2e1553e1
TCGA-BRCA PanCancer Atlas 공개 mRNA·체세포 복제수·임상 PFS
19-1 · Phenopacket Store 0.1.27 · HPO v2022-12-15 · HGNC 2022-10-01
Monarch Phenopacket Store + 2022년 Human Phenotype Ontology
19-1 · 2022-12-17
NCBI ClinVar GRCh38 VCF 역사 기록
19-1 · 공개 적격 세트 미확정
환자별 VCF·HPO 및 독립 판독 정답의 결합 세트
평가 전에 적은 경계 사례
5-1 · AI 신약발굴
- 서로 다른 골격과 동족 표적군 사이 평가 누수
- 결합 활성 지표의 측정 조건과 단위 불일치
- 구조 유사도 0.4 이하, 100 ns 궤적에서 RMSD 2.0 Å 이하, 5단계 이내 역합성은 첨부 명세의 보조 기준
8-1 · 합성데이터
- 데이터 분할을 넘나드는 원본 행과 동일인 기록
- 차분 프라이버시 예산과 합성자료의 원본 기록 근접성 점검
- 생물학적으로 불가능한 변수 조합 발생률 0%라는 내부 목표
19-1 · 희귀질환 판독
- 알려진 변이를 포함한 가상 사례에서 유전자 순위 평가
- 표현형이 빠지거나 오기된 경우 근거와 순위가 바뀌는지 검토
- 참조 빌드 불일치, 제출자 분류 충돌, 근거 문헌 연결 누락
근거가 닿는 범위
5-1
계산 점수와 화학 지표가 확인하는 범위는 계산 벤치마크입니다. 특허 신규성, 실제 합성, 독성과 치료 효과는 각자 다른 근거를 요합니다.
8-1
TCGA·GEO·MIMIC-IV 간 동일인 연결이나 공통 관찰기간을 전제로 삼지 않습니다. 실측 검증은 각 자료의 종점과 사용 조건 안에서 분리합니다.
19-1
이미 사용한 변이 주석이나 유전자·질환 연결의 정답을 평가 입력에서 그대로 읽으면 순위 성능이 부풀려집니다.